La collection permanente d'objets du musée du 11 septembre, qui ne cesse de s'enrichir, commémore et rappelle les héros qui se sont battus, ont survécu et ont donné leur vie lors des attaques du World Trade Center en 2001 et 1993. Il s'agit d'un dépôt inégalé et émouvant d'objets personnels, de preuves matérielles, de témoignages et d'artefacts historiques qui racontent les histoires tragiques de ces événements marquants. Les types de reliques varient considérablement, des bottes de survivants aux cartes de commémoration et de prière, en passant par les cartes d'identification du WTC, et bien d'autres choses encore.
Parmi les objets les plus remarquables, citons le sac de Patricia Fagan (découvert un an et demi plus tard), une employée de la tour sud du World Trade Center décédée lors des attentats ; une lettre rouge tombée d'un avion détourné le 11 septembre, ramassée dans la rue par un homme d'affaires en fuite et postée à sa destination légitime (qui fait maintenant partie de la collection) ; un râteau à main utilisé par les travailleurs qui ont fouillé Ground Zero à la recherche de restes humains ; et une collection d'objets recueillis lors d'une veillée après le 11 septembre, dont un drapeau portant l'inscription "we will survive", un ours en peluche et une maquette des tours jumelles.
