Der Bronx Zoo ist aus der Naturschutzbewegung des späten 19. Jahrhunderts entstanden. Im Jahr 1895 wurde die New York Zoological Society, die heute als Wildlife Conservation Society (WCS) bekannt ist, gegründet, um die zoologische Forschung, die öffentliche Bildung und den Schutz der Wildtiere zu fördern.
Der Zoo wurde 1899 offiziell eröffnet und zeigt 843 Tiere in 22 Ausstellungsräumen. Mit Unterstützung von Präsident Theodore Roosevelt züchtete der Zoo Bisons und führte sie erfolgreich in geschützten Gebieten im Westen der Vereinigten Staaten wieder ein.